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食品在存放過(guò)程中會(huì)發(fā)生一系列的物理化學(xué)變化，不適宜的存放條件可能使食物被微生物、外來(lái)化學(xué)物質(zhì)污染或者發(fā)生自身化學(xué)反應(yīng)，影響食物的風(fēng)味甚至危害人體健康。例如真菌在食物的生產(chǎn)過(guò)程中(比如啤酒釀造、奶酪生產(chǎn))起著積極作用，但是在食物的存放過(guò)程中也會(huì)對(duì)食物產(chǎn)生消極影響，特別是在溫暖潮濕的環(huán)境下會(huì)快速繁殖產(chǎn)生生物毒素。因此其早期的快速實(shí)時(shí)檢測(cè)發(fā)現(xiàn)就尤為重要。利用離子遷移譜來(lái)檢測(cè)芝士表面菌群生長(zhǎng)前后的揮發(fā)性成分來(lái)判斷是否被污染。在真菌生長(zhǎng)前IMS檢測(cè)到保留時(shí)間0.8、4.0.8.3min處有明顯信號(hào)峰，真菌生長(zhǎng)后則4.0、8.3min處的信號(hào)峰消失，0.8min處的信號(hào)峰強(qiáng)度顯著降低，而在1.0、13.5、20.5min處出現(xiàn)新的真菌代謝產(chǎn)物信號(hào)峰，推測(cè)是由于真菌生長(zhǎng)導(dǎo)致芝士原本揮發(fā)性成分的稀釋。結(jié)果表明離子遷移譜可用于控制有益菌的生長(zhǎng)，檢測(cè)有害菌的代謝產(chǎn)物。肉類在存放過(guò)程中同樣會(huì)被細(xì)菌降解形成一些具有致癌作用的生物胺。

用離子遷移譜直接檢測(cè)雞肉汁中的三甲胺，方法檢測(cè)限為 (0.6+0.2) ng，結(jié)果顯示，存放天數(shù)不同、損壞程度不同的肉汁能被儀器快速區(qū)分出來(lái)。常用的2，4，6-TCA檢測(cè)方法是先收集樣品，再用離子遷移譜檢測(cè)，檢測(cè)限通常在1-100ng/L，食物中的多不飽和脂肪酸(PUFAs)，比如二十碳五烯酸(EPA)和二十二碳六烯酸(DHA) ，對(duì)人類健康有益。但其化學(xué)性質(zhì)很不穩(wěn)定容易受氧氣、溫度、光照和一些離子 (Cu、Fe等)的影響發(fā)生氧化反應(yīng)而出現(xiàn)不良?xì)馕赌坑绊懯澄锟诟?。用頂空自?dòng)進(jìn)樣、離子遷移譜聯(lián)用的方法，對(duì)四種口味的牛奶和一種亞麻籽油中的脂肪酸氧化狀況進(jìn)行實(shí)時(shí)檢測(cè)。毛細(xì)管柱連接在自動(dòng)進(jìn)樣器和離子遷移譜中間，起到初步分離揮發(fā)性物質(zhì)的作用。結(jié)果顯示，裝置能快速有效地檢測(cè)到己醛、丁酮、丙酮、二甲基硫醚等主要的脂肪酸降解產(chǎn)物，檢測(cè)限在0.3-3.0g/L之間。進(jìn)一步分析檢測(cè)不同溫度、氧氣和光照條件下各樣品存放36d內(nèi)的變化，發(fā)現(xiàn)光對(duì)牛奶中脂質(zhì)的氧化作用影響最大，而溫度則對(duì)亞麻油中脂質(zhì)的影響最大。